Lambang
Lambang Fakultas Ekonomi dan Bisnis Islam IAIN Purwokerto sama dengan lambang IAIN Purwokerto dengan ditambah kalimat Fakultas Ekonomi dan Bisnis Islam di bawah lambang tersebut.
Bendera
Bendera Fakultas Ekonomi dan Bisnis Islam berwarna Merah Muda yang melambangkan Kepercayaan (Trust), Ketegasan, Keteraturan dan Kepedulian dengan lambang IAIN Purwokerto di tengahnya dan tulisan “Fakultas Ekonomi dan Bisnis Islam” di bawah lambang tersebut.